wtorek, 12 maja 2020

2. Chemiczne podstawy życia

   

Pierwiastki

Związki nieorganiczne - substancji niezawierające węgla, wyjątki to dwutlenek węgla CO2 oraz kwas węglowy H2CO3 i jego sole 

Związki organiczne - głównym składnikiem jest węgiel, oprócz wyjątków powyżej 


MIKROELEMENTY (poniżej 0.01% suchej masy)  np. Fe Cu Zn Mn Mo B Se CR I F

MAKROELEMENTY (powyżej 0.01% suchej masy) np. Ca Mg Na K Cl

pierwiastki biogenne   C H O N S P   - budują wszystkie organizmy

(polecam zapamiętać sobie słowo Chonsp lub Ponchos - wtedy łatwo zapamiętać które to są te biogenne) 


SIARKA - składnik aminokwasów budujacuch białka, umożliwia on tworzenie dodatkowych wiązań tzw. mostków disiarczkowych, obecność w wytworach naskórka

FOSFOR - występuje w kwasach nukleinowych, buduje błony komórkowe, składnik ATP, reguluje procesy przemiany materii i energii, buduje kości i zęby 

WAPŃ - składnik muszli i pancerzy, niezbędny w funkcjonowaniu komórek nerwowych, bierze udział w krzepnięciu krwi. Niedobór to krzywica u dzieci, osteoporoza, próchnica zębów, zaburzenia krzepnięcia krwi i drgawki 

MAGNEZ - składnik kości, aktywator enzymów, niezbędny do uzyskiwania energii z ATP, składnik chlorofilu. Niedobór to zwiększenie pobudliwosci komórek nerwowych i mięśni, zaburzenia rytmu serca, zahamowanie fotosyntezy 

POTAS - bierze udział w przewodzeniu impulsów nerwowych, składnik płynów ustrojowych, zwiększa stopień uwodnienia płynu wewnątrz komórkowego, wpływa na skórę i mięśnie, aktywator enzymów roślinnych. Niedobór to zaburzenia rytmu serca i osłabienie pracy mięśni 

SÓD - bierze udział w przewodzeniu impulsu nerwowego składnik płynów ustrojowych, zwiększa stopień uwodnienia płynu wewnątrz komórkowego. Niedobór utrata podbudliwosci komórek nerwowych

ŻELAZO - składnik transportujacej tlen hemoglobiny i magazynujacej mioglobiny, składnik enzymów fotosyntezy i oddychania komórkowego. Niedobór anemia, zaburzenia rytmu serca i oddychania kom. 

JOD - składnik hormonów tarczycy. Niedobór to wolę tarczycy, obrzęk skóry, niedorozwój umysłowy 


WODA

  • dipol, cząsteczka polarna    (+H)2  (- O) 

  • uniwersalny rozpuszczalnik, środowisko przebiegania wszystkich reakcji chemicznych w organizmie 

  • kohezja (spójność) czyli duże napięcie powierzchniowe dzięki licznym wiązaniem wodorowym np. Nartnik biega po wodzie 

  • adhezja (przyleganie) przyleganie do substancji i zwilżanie ich. 

  • lód jest mniej gestszy niż woda i tworzy warstwę izolacyjną przez utrata dalszego ciepła i zamarzaniem zbiornika do dna

  • wysokie ciepło parowania trzeba dostarczyć dużo egengii aby zerwać wiązania wodorowe by woda przeszła w gaz przez to właśnie pełni funkcje termoregulacyjną chroniąc przed przegrzaniem. Jendoczesnie jest dobrym przewodnik ciepła szybko wyrownujacym temperaturę 

  • duże ciepło właściwe wolno zmienia temperaturę nie ma wahań 


Sole mineralne

wiele funkcji m.in. Są buforami, uniemożliwiając zmianę pH środowiska 


Węglowodany, sacharydy, cukry

CH2O       stosunek 2:1     wodór i tlen


MONOSACHARYDY - jednocukry, mają do 7 atomów węgla, tworzą pierścienie gdzieki mostkom tlenowyn między gruba aldehydowa/ketonową a jedną z grup hydroksylowych

* Aldehyd glicerynowy - występuje w reakcjach oddychania kom. 

* Ryboza - składnik RNA, niektórych witamin i ATP 

* Deoksyryboza - DNA 

* Glukoza - w miodzie i sokach, substrat w procesie oddychania kom. 

* Frutoza - najsłodszy cukier w miodzie i sokach 

* Galaktoza - w mleku w laktozie


OLIGOSACHARYDY - powstają przez połączenie cukrów prostych od 2 do 5 wiązaniem O-glikozydowym, reszty tlenowe połączone są mostkiem tlenowym

Disacharydy produkty kondensacji:

A + A —> AA + H2O

* Laktoza — glukoza i galaktiza (rozkłada ją enzym Laktaza) składnik melka ssaków 

* Sacharoza — glukoza i fruktoza  główna firma transportowa cukrów 

* Maltoza — glukoza x2 w pyłku wabi owady 


POLISACHARYDY - zbudowane z dużej ilości monosacharydow połączonych wiązaniami O-glikozydowymi, są nie rozpuszczalne w wodzie podczas gdy mono i ogli są rozpuszczalne

(Zapasowe) 

* Skrobia - (amyloza i pektyna) materiał zapasowy roślin. Ma mostki tlenowe zwrócone w tą samą stronę dzięki czemu tworzy spiralny łańcuch 

* Glikogen - u grzybów i baterii występuje w komórkach, u zwierząt w kom wątroby i mięśni szkieletowych, materiał zapasowy u zwierząt i grzybów 

(Budulcowe) 

* Celuloza - składnik ścian komórkowych roślin oraz protistoe grzybopodobnych. Długie proste nierozgałęzione łańcuchy przez ułożone naprzemiennie zwrócone mostki tlenowe. Spłata się w włókna celulozowe odporne na rozciąganie 

* Chityna - składnik ścian kom. grzybów i oskórka stawonogow. Podobna do glukozy różni się tylko że zamiast - OH ma - NH2


Wykrywanie cukru - odczynniek Fehlinga I i II, ceglastoczerowny osad 

Wykrywanie skrobi - płyn Lugola (jod/jodyna/roztwór jodu w jodku potasu) , ciemny niebieskofioletowy kolor


Lipidy 

Mają niepolarne cząsteczki i nie rozpuszczają się w wodzie, są rozpuszczalinikiem polarnym, mają gęstość mniejszą niż woda 


* lipidy proste *

Sa estrami, produktami kondensacji alkoholi (glicerol) i kwasów 

Bogatoenegetyczny materiał zapasowy 

-tłuszcze zwierzęce, są stałe, głównie nasycone kwasy tłuszczowe 

-tłuszcze roślinne płynne nienasycone kwasy tłuszczowe 

-woski np. Pszczeli, na piórach, lanolina


* lipidy złożone *

Budulec błon komórkowych np. Fosfolipidy oraz glikolipidy


ogony hydrofobowe

głowy hydrofilowe 


* lipidy izoprenowe *

STEROIDY - pierścieniowa budowa np.

Cholesterol

płaska budowa w błonie kom. uelastycznia ją 

w kom nerwowych ma wpływ na sprawny przebieg impulsu 

składnik żółci wydzielanej przez wątrobę 

składnik hormonów steroidowych kory nadnerczy oraz gametów

witaminy D wpływając na wchłanianie wapnia do kości 

KAROTENOIDY - żółte pomarańczowe i czerowne barwniki, uczestniczące w fotosyntezie, naturalne oksydanty (opóźniają utlenianie), antyrodnikowe

Betakaroten (pomarańczowy) - przekształcany w Witamine A która wpływa na proces widzenia, 


Wykrywanie tłuszczy - Sudan III zamiana koloru na czarowny 


Białka

  • strukturalne - utrzymanie kształtu  

(tubulina, kolagen, elastyna, keratyna) 

  • enzymatyczne - przyspieszenie reakcji 

(pepsyna, trypsyna) 

  • przekazywanie informacji - hormony białkowe  

(insulina) 

  • magazynujace substancje w momencie deficytu 

(mioglobina) 

  • odpowiedzialne za ruch komórki 

(aktyna, miozyna) 

  • transportujace substancje do wnętrza i na zewnątrz komórki - związane z błoną kom. 

(ATP-aza sodowo-potasowa) 

  • transportujace sub w obrębie organizmu 

(hemoglobina) 

  • odpornościowe - uczestniczą w reakcjach obronnych 

(przeciwciała) 

  • zapasowe - głównie w nasionach jako ziarna alurenowe u człowieka tylko w kom. jajkowej 


AMINOKWASY 

-podstawówka jednostka budulcowa białek 

-składa się z centralnie usytuowanego atomu węgla, połączonego wiązaniami kowalencyjnymi z grupą aminową - NH2, grupą karboksylową - COOH, atomem wodoru oraz charakterystyczna dla każdego aminokwasu grupą boczna/podstawnikiem, który determinuje specyfikę właściwości każdego aminokwasu 


* Cząsteczki aminokwasów są asymetryczne  (poza glicyną) mogą występować w dwóch izomerach D i L będącymi lustrzanymi odbiciami. Nie różnią się właściwościami są jednak rozpoznawane przez inne cząsteczki i enzymy. W skład białek wchodzą wyłącznie L-aminokwasy.

* Wszystkie białka zbudowane są z 20 rodzajów aminokwasów, które łączą się ze sobą wiązaniani peptydowymi (połączenie gr. karboksylowej i gr. aminowej dwóch aminokwasów) 


  • oligopeptydy (zawierają 2-10 aminokwasów)  np. wazopresyna i oksytocyna

  • polipeptydy (11-100) np. insulina 

  • białka są to makropeptydy (zawierają więcej niż 100 aminokwasów w łańcuchu) np. albumina - białko osocza krwi




–> białka fibrynalne  (włókiniste)

nie rozpuszczaja się w wodzie, wchodzą w skład elementów struktury organizmów np. keratyna i kolagen

–> białka globuralne (kuliste)   

rozpuszczalne w wodzie i wodnych roztworach, są enzymami, hormonami, uczestniczą w transporcie, są materiałem zapasowym np. 

ALBUMINY składnik osocza krwi, bufory, odpowiadają za transport kwasów tłuszczowych i niektórych hormonów oraz za regulacje ciśnienia osmotycznego krwi

GLOBULINY (przeciwciała) odpowiadają za odporność oraz transport hormonów sterydowych 

HISTONY występują w jądrze komórkowym, wraz z DNA tworzą chromatyne 


  • Białka mogła być PROSTE zbudowane tylko z aminokwasów i ZŁOŻONE np. Glikoproteiny, fosfoprotieny, lipoproteiny, hemoproteiny i metaloproteiny

  • Białka rozpuszczają się w wodzie tworząc koloid. 

  • Wodny roztwór białka to zol. 

  • Po dodatniu do zolu soli metali lekkich np NaCl zachodzi KOAGULACJA - powstaje żel, jest to proces odwracalny. 

  • DENATRUACJA nieodwracalny proces zmiany struktury białek (potocznie "ścinanie") zachodzi pod wpływem czynników fizycznych np. temperatura powyżej 40°C lub chemicznych np. stężony kwas lub zasada. Skutkiem jest zerwanie wiązań stabilizujacych przestrzenną strukturę białka i tym samym nieodwracalna utrata właściwości 




  1. STRUKTURA PIERWSZORZĘDOWA BIAŁKA

istnieje dzięki wiązaniom peptydowym 

  1. STRUKTURA DRUGORZĘDOWA BIAŁKA (alfa-helisa i beta-harmonijka) 

-  powstaje w skutek wytworzenia wiązań wodorowych 

  1. STRUKTURA TRZECIORZĘDOWA BIAŁKA

pofalowanie struktury drugorzędowe, utrzymuje się dzięki wiązaniom wodorowym oraz (S-S) mostkom dwusiarczkowym oraz innym możliwym wiązaniom

  1. STRUKTURA CZWARTORZĘDOWA BIAŁKA  powstaje przez połączenie kilku podjednostek białka o strukturze trzeciorzedowej.  Np. Hemoglobina - 4 łańcuchy polipeptydowe, a każdy z nim zawiera cząsteczke 'hem'



REAKCJA BIURETOWA działając roztworem CuSO4 w środowisku zasadowym na białko, otrzymujemy fioletowe zabarwienie (wykrywanie wiązania peptydowego),

REAKCJA KSANTOPROTEINOWA (wykrywanie białek zawierających pierścienie aromatyczne w łańcuchach bocznych): działając stężonym HNO3 na białko tworzy się żółte zabarwienie charakterystyczne dla powstających związków nitrowych.


Białka w środowisku kwaśnym, zasadowym lub pod wpływem enzymów ulegają hydrolizie do aminokwasów.

Kwasy nukleinowe

DNA - KWAS DEOKSYRYBONUKLEINOWY 

RNA - KWAS RYBONUKLEINOWY

Są to polimery stworzone z nukeotydów

każdy nukeotyd składa się z:

* jednej z zasad azotowych: adeniny, cytozyny, guaniny  oraz w DNA tyminy a w RNA uracylu

(Między adeniną a tyminą powstają dwa wiązania a między cytozyna a guaniną powstają trzy wiązania) 

* cukru pięcioweglowego detoksrybozy w DNA i rybozy w RNA

* reszty kwasu fosforowego (V) 


Nukleotydy łączą się ze sobą za pomocą wiązania fosfodiestrowego między reszta fosforanową a czasteczką cukru kolejnego nukleotydu. Razem tworzą łańcuch polinukleotydowy 


Cząsteczka DNA składa się z dwóch łańcuchów polinukleotydowych skręconych śrubowo wokół własnej osi "podwójna helisa" i utrzymuje się ona dzięki licznym wiązaniom wodorowym między zasadami azotowymi między dwoma łańcuchami. Powstają one dzięki komplementarnosci zasad azotowych  

A=T/U    C=G


Wpływa to na to że dwie nici są do siebie komplemetarne - sekwencja jednej nici jest wyznaczona przez drugą przez co jest możliwie odtworzenie jej (replikacja DNA) 


białka histonowe - "pakują" DNA do jądra komórkowego 


w kom. prokariotycznych DNA ma postać kolistej cząsteczki 'genofory' zanurzonej w cytoplazmie. Niektóre bakterie mają ponadto niewielkie cząsteczki DNA 'plazmidy' zawierające zdobyte informacje warunkujace dostosowanie się do życia np. Geny odporności na antybiotyki


* mRNA - informacyjny - przenosi informacje genetyczną z jądra na miejsce syntezy białek 

* tRNA - transpotujacy - transport uje aminokwasy na rybosomy gdzie odbywa się synteza białek 

* rRNA - rybosomowy - buduje rybosomy



Brak komentarzy:

Prześlij komentarz